美國歷史最悠久的私立大學哈佛與白宮的矛盾急劇升級。

美東時間6月5日，哈佛大學就特朗普政府禁止其國際生入境的決定提起訴訟。哈佛方面表示，特朗普刻意回避法官放行其繼續招收國際生的命令，此舉不是為了保護所謂的國家利益，而是為了報復。

本輪巴以沖突爆發后，常青藤成員、加州大學系等引領的美國高校學生反猶活動此起彼伏，并逐步蔓延到了整個高等教育界。第二次入主白宮之后，特朗普誓言要對被其視為左翼大本營的大學采取行動，試圖迫使后者遵守他的政治議程。歷史最悠久的私立大學哈佛成為重點目標。

今年3月，聯邦教育部、衛生與公共服務部和總務管理局聯合勒令哈佛進行10點整改要求，包括對領導結構、招生和招聘進行徹底改革。具體措施為向聯邦政府提供所有錄取學生數據、禁止校園抗議活動參與者戴面罩、立即關閉包容性（DEI）項目、打擊反猶太主義等，否則將審查87億美元撥款以及總值2.556億美元的項目合同。

在哈佛明確拒絕后，特朗普政府于4月中旬凍結了20多億美元的聯邦撥款資金，還考慮再凍結10億美元撥款，發起針對哈佛運營的多項調查、威脅國際學生的教育、宣布考慮撤銷哈佛大學的免稅資格等。

5月22日，國土安全部根據特朗普命令暫停哈佛招收國際學生的資格，后者的學生和交流訪問者項目（SEVP）認證被撤銷。隨后加州聯邦法官杰弗里·懷特法官發布了全美范圍的臨時禁令，阻止其在相關案件審理期間終止各大學（包括哈佛）國際學生合法身份的措施生效，還禁止其以移民身份為由，逮捕或拘留在美國之外出生的學生。

5月29日，馬薩諸塞州聯邦地區法院法官也批準了哈佛提出的發布初步禁令請求，叫停特朗普政府取消哈佛招收外國學生資質的政策，待各方協商并提交提議供法官下一步審議之后，將發布最終的初步禁令。

但就在5月29日聽證會的前一天，國土安全部突然向哈佛發出通知，給予后者30天的時間，對政府撤銷其招收外國學生和交流學者資格的政策提出異議。

6月4日，特朗普又簽署公告，暫停國際生作為哈佛新生進入美國。他還準備撤銷部分在讀哈佛學生的簽證。白宮指出，特朗普的公告將暫停在F、M和J簽證類別下的非移民哈佛新生進入美國，限制期為6個月。F類簽證為學術類學習的學生簽證，M類簽證為職業技術、非學術類學生簽證，J類簽證為交流訪問學者簽證。該限制不針對通過學生交換簽證項目（SEVP）在其他美國大學讀書的外國人。

聲明稱，美國聯邦調查局多年來一直警告美國的外國對手利用美國高等教育竊取信息、傳播錯誤消息。因此為了保護美國的國家安全，接收外國學生的美國教育機構應該在被要求時提供相關信息，協助聯邦政府解決外國學生的行為不當問題。特朗普認為，如果一所學術機構拒絕就外國學生的行為不當和犯罪情況提供充足信息，將對美國國家安全構成“不可接受”的風險。